识别单碱基突变的DNA分子机器
单碱基突变(single-base polymorphisms, SNPs)是人基因组中常见的突变类型之一,它与表型变化,基因功能,发生息息相关。因此,开发强特异性的方法来鉴别寡核苷酸序列中的单碱基变化具有非常重要的意义。
支点(toehold)是指DNA双链末端所悬挂的粘性末端,一般为4-8个碱基所组成的单链DNA片段。支点介导链置换(toehold strand displacement reaction, TSDR)由Yurke等人设计并系统论证,该反应能在常温下进行、易于操作且严格受核酸序列控制,具有很高的特异性。因此,toehold调节的链置换反应为检测SNPs提供了另一种可能的方法。
示意图.该体系设计包括一种功能化AuNP的双链DNA探针称呼为S和另一种功能化AuNP的DNA探针作为燃料。初它们在一种亚稳态混合物中,这种混合物在热力学上有利于它们反应。然而,由于缺乏toehold位点,反应只能在另一条单链DNA催化剂x(m,n)的帮助下完成。S探针是由连接探针(αj`βm`βm`γn)改希腊字母和保护探针(βm βm)组成,同时它有2个未杂交区域:红色(γn)和紫色(αj)。初,红色区域(γn)作为**个toehold区域,催化剂x(m,n)结合到该toehold区域,通过TSDR释放保护探针,从而产生中间体并将绿色区域(βm)暴露。接下来,绿色区域(βm)和紫色(α)为中间体和燃料之间的TSDR反应提供了新的toehold区域,该反应导致AuNP的聚集组装产生颜色变化,并将催化剂x(m,n)释放回溶液中进行新一轮的循环TSDR反应。如果催化剂x(m,n)存在单碱基错配,由于TSDR具有很强的序列特异性,所以**步反应速度会受到抑制,导致AuNP的聚集组装受到抑制。
西安齐岳生物可提供的质粒构建服务包括:
(1)过表达质粒构建;
(2)诱导基因的定点突变;(单碱基突变,多碱基突变)
(3)构建基因截短体质粒;
(4)亚克隆质粒构建;
(5)通过慢病毒介导的基因过表达;
(6)通过构建shRNA慢病毒质粒实现基因的敲减
(7)通过CRISPR-Cas9技术实现基因敲除
注意事项:
本产品仅供科研使用,严禁用于人体或其他非科研用途。
使用过程中请佩戴手套和护目镜等防护用品,避免直接接触皮肤和眼睛。
请按照相关文献和相关安全规定进行操作,避免误用或滥用。如有侵权,可联系我们删除