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RNA干扰稳定表达细胞株构建原理
发布时间:2024-12-16     作者:axc   分享到:

RNA干扰稳定表达细胞株构建原理

RNA干扰(RNA interference, RNAi)稳定表达细胞株的构建原理:病毒包装的shRNA整合到宿主基因组中,RNA聚合酶Ⅲ通过识别特定的启动子(U6, H1)启动转录,在TTTT序列处RNA聚合酶Ⅲ掉落,shRNA停止转录后自动折叠并被分泌到胞质内,Dicer可以识别细胞质内的shRNA并切割颈环(loop)使其成为siRNA,后者与RNA干扰复合体(RNA induced silencing complex,RISC)结合后降解特定的mRNA分子,进而对特定基因的表达进行敲减。因为有引导RNA的作用,少量的引导RNA就可以引发大量特定的mRNA被切割,敲减效率很高

RNA干扰稳定表达细胞株构建原理

病毒包装的载体包括稳定表达型载体和诱导表达型载体。两者的酶切位点是一样的,为Age1和EcoR1

shRNA:具有发夹结构+茎区成对的反义和正义链(各21bp)+未配对的成环核苷酸

shRNA干扰载体并构建若通过直接转染siRNA进行基因沉默,直接进行化学合成即可。若通过质粒或病毒如慢病毒(LV)、腺相关病毒(AAV)长期或体内递送siRNA,需提前构建合适的核心质粒,并生产相应的质粒或病毒颗粒使其在细胞或体内进行表达。选择合适的表达载体至关重要,以AAV为例:


1.基于U6/H1启动子的 shRNA 干扰载体shRNA是一类小/短发夹的双链RNA,由于构建序列较短,需使用特定的pol III型启动子U6或者H1实现体内的表达。U6/H1启动子具有表达能力强,表达范围广等优点,常用于实现全脑区或组织内的基因干扰。以AAV病毒核心质粒为例,载体结构如下: 

RNA干扰稳定表达细胞株构建原理

西安齐岳生物可提供的质粒构建服务包括:

(1)过表达质粒构建;

(2)诱导基因的定点突变;(单碱基突变,多碱基突变)

(3)构建基因截短体质粒;

(4)亚克隆质粒构建;

(5)通过慢病毒介导的基因过表达;

(6)通过构建shRNA慢病毒质粒实现基因的敲减

(7)通过CRISPR-Cas9技术实现基因敲除


定制服务:

截断突变载体系统

基因截短的重组表达质粒pET28a—NS1-RBD和pET28a—NS1-ED

Nrd1点突变体和截短体

构建N端,C端,N+C端单结构域缺失的截短体质粒

构建CSD(氨基酸39-112)单结构域缺失的截短体质粒

构建ZFD(氨基酸137-176)单结构域缺失的截短体质粒

eGFP-LIN28A敲入的小鼠胚胎干细胞E14细胞系

eGFP-LIN28A过表达小鼠胚胎干细胞E14细胞系

全长人环核苷酸磷酸二酯酶4B2截短突变体(152aa-528aa)

功能域截短体的原核表达质粒

SCIRR 10蛋白截短体真核表达载体


注意事项:

本产品仅供科研使用,严禁用于人体或其他非科研用途。

使用过程中请佩戴手套和护目镜等防护用品,避免直接接触皮肤和眼睛。

请按照相关文献和相关安全规定进行操作,避免误用或滥用。如有侵权,可联系我们删除


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