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Crispr/Cas9系统实现基因编辑/敲除/敲入,操作步骤
发布时间:2024-12-16     作者:axc   分享到:

Crispr/Cas9系统实现基因编辑/敲除/敲入,操作步骤

Crispr/Cas9操作步骤由于Crispr/Cas9系统应用广泛,可以实现基因编辑,完成基因的敲除/敲入,还可以进行基因表达调控和剪辑替换。因此我们对Crispr Cas9系统展开讲述具体的操作方法(后台回复 Crispr 可获得基因编辑技术资料)。

1.确定目的基因及序列:NCBI、Ensembl、DDBJ,可获取序列

2.基因组靶点的重要特征包括:长度大约为20个核苷酸;序列带有PAM序列。

3.设计gRNA:不包含PAM序列;可以是基因组DNA的任一条链;对于基因组破坏,gRNA靶定的位点应靠近蛋白编码区的N端,以便增加基因破坏的可能性。

.sgRNA的设计要求:

Cas9会在目标DNA上切开双链,如果把其中一个核酸酶活性位点突变掉,它就变成了一个切口酶。用一对这样的sgRNA把这种切口酶带到基因组上的特异位点,这样就大大提高了靶向的特异性。
1)长度一般应为20nt 左右;
2)对于sgRNA序列的碱基组成,可选3'末端含GG的sgRNA,同时sgRNA 种子序列尽量避免以4 个以上的T结尾,GC%含量佳为40%~60%;
3)sgRNA的种子序列与脱靶位点的匹配数尽可能低;
4)如果构建U6或T7启动子驱动sgRNA的表达载体,需考虑sgRNA的5'碱基为G或GG,以提高其转录效率;
5)对于sgRNA靶向基因的结合位置,如需造成基因移码突变,需尽量靠近基因编码区的ATG下游,好位于第一或第二外显子;
6)检查sgRNA靶向结合位点基因组序列是否存在SNPs;
7)如采用Cas9单切口酶,设计paired-gRNA需考虑成对sgRNA的间距;
8)全基因脱靶效应分析,需考虑脱靶位点大允许几个错配碱基数,建议少5个碱基。重点考察种子序列和非种子序列碱基错配数,以及脱靶位点是否位于基因编码区等,另外还可考察是否存在碱基插入或缺失的脱靶位点。

Crispr/Cas9系统实现基因编辑/敲除/敲入,操作步骤


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西安齐岳生物可提供的质粒构建服务包括:

(1)过表达质粒构建;

(2)诱导基因的定点突变;(单碱基突变,多碱基突变)

(3)构建基因截短体质粒;

(4)亚克隆质粒构建;

(5)通过慢病毒介导的基因过表达;

(6)通过构建shRNA慢病毒质粒实现基因的敲减

(7)通过CRISPR-Cas9技术实现基因敲除


注意事项:

本产品仅供科研使用,严禁用于人体或其他非科研用途。

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