CRISPR/Cas9技术基因敲除鼠的构建
基因编辑小鼠主要分为基因敲除(KO)、条件性敲除(CKO)及基因敲入(KI)等几种方式。其中基因敲除鼠(KO)是基因编辑鼠中常用、也是容易构建的模型鼠,但是这样一种模型鼠的设计和构建过程依然复杂。本文就以CRISPR/Cas9技术为例,为大家科普一下基因敲除鼠的设计、构建、鉴定与使用方法。
基于CRISPR/Cas9技术基因敲除鼠的构建过程就如下图所示:主要包括其中,gRNA设计和筛选,sgRNA表达载体构建,显微注射,胚胎移植,小鼠培育及繁殖及小鼠基因型鉴定等过程。详情请点击(基因编辑鼠的构建)
sgRNA设计及表达载体构建
其中,sgRNA的设计是通过在目标基因N端编码序列中寻找合适的靶序列完成的,可以利用软件(sgRNA Designer)预测潜在sgRNA序列。经过在脱靶率预测后,在细胞中进行活性筛选后,取脱靶率较低的sgRNA构建打靶载体。随后将上述sgRNA与Cas9-mRNA一起注射入体外受精小鼠受精卵的胞浆部分,并将之移入假孕母鼠体内发育为子代小鼠。
小鼠基因型鉴定
胚胎移植后的小鼠约19天后出生,取子代小鼠的基因组DNA进行基因型鉴定,即所谓的Founder,F0代。基因鉴定一般利用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction, PCR),即利用引物大量扩增目的片段。一般我们会选取目的片段上下游200-300bp长度的序列作为引物设计的对象。
①如果缺失的DNA片段有成百甚至上千个碱基,这样可以通过PCR产物长度来区分突变型和野生型小鼠基因型,较长即为未敲除片段,较短则为已敲除片段;
②如果缺失为几bp或者几十bp 无法通过PCR电泳图来区分野生型和突变型,那么需要进一步通过T7E1酶切或者测序的方法进行区分。如下图所示:
基因敲除纯合子(-/-):只带有已敲除片段的小鼠为纯合子;
基因敲除杂合子(+/-):同时带有已敲除和未敲除片段的小鼠为杂合;
野生型小鼠(+/+):只带有未敲除片段;
西安齐岳生物可提供的质粒构建服务包括:
(1)过表达质粒构建;
(2)诱导基因的定点突变;(单碱基突变,多碱基突变)
(3)构建基因截短体质粒;
(4)亚克隆质粒构建;
(5)通过慢病毒介导的基因过表达;
(6)通过构建shRNA慢病毒质粒实现基因的敲减
(7)通过CRISPR-Cas9技术实现基因敲除
注意事项:
本产品仅供科研使用,严禁用于人体或其他非科研用途。
使用过程中请佩戴手套和护目镜等防护用品,避免直接接触皮肤和眼睛。
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