磺酸CY3-PEG-COOH 是一种结合了磺酸花菁染料Cy3、聚乙二醇（PEG）和羧基（-COOH）的近红外荧光探针。这种化合物利用PEG的生物相容性和水溶性，以及羧基的高反应性，能够与胺基（-NH₂）或其他活性基团发生偶联反应，形成稳定的酰胺键。

磺酸Cy3 是一种近红外荧光染料，其激发波长约为550 nm，发射波长约为570 nm，具有较高的荧光强度和光稳定性，适合用于生物成像和诊断。磺酸基团（-SO₃⁻）的存在进一步提高了染料的水溶性和生物相容性。

在应用方面，磺酸CY3-PEG-COOH可用于标记蛋白质、肽、寡核苷酸等生物分子，通过与这些分子上的胺基反应，引入荧光标记。

例如，在蛋白质标记中，磺酸CY3-PEG-COOH可用于实时监测蛋白质的分布和动态变化，为细胞生物学和分子生物学研究提供重要的工具。

此外，这种探针还可用于构建荧光生物传感器，用于检测生物分子的相互作用。其近红外荧光特性使其在组织成像和活体成像中具有较高的灵敏度和特异性。

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