产品名称：Cy3 SE(mono SO3)的核心结构

结构组成

1 核心结构

Cy3骨架：

由两个吲哚环通过三甲川桥（CH₂CH₂CH₂）连接，形成共轭体系，吸收波长为 550-570 nm，发射波长为 570-590 nm（橙红色荧光）。

琥珀酰亚胺酯（SE）：

连接在Cy3骨架的侧链氨基上，结构为 -O-CO-NHS（NHS酯为活性酯，可与氨基反应形成酰胺键）。

单磺酸盐（mono SO3）：

通常连接在其中一个吲哚环的苯环上（如4号位），结构为 -SO₃⁻（钠盐形式），显著增强化合物的水溶性。

2 结构示意图

吲哚环-CH₂-CH₂-CH₂-吲哚环（Cy3骨架）

   |

   O-CO-NHS（琥珀酰亚胺酯）

   |

   SO₃⁻（单磺酸盐）

3 物理性质

外观：深红色或橙红色结晶性粉末

溶解性：易溶于水、PBS缓冲液或极性有机溶剂（如DMF、DMSO），难溶于非极性溶剂（如己烷）。

光谱特性：

吸收波长（λₐ₆）：550-570 nm

发射波长（λₑₘ）：570-590 nm

摩尔消光系数（ε）：约150,000 M⁻¹cm⁻¹

稳定性：在避光、干燥、pH 7-8条件下稳定，避免强酸/强碱或高温（＞40℃）。

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