化学结构与性质

sulfo-Cyanine5.5 dUTP是含有荧光染料sulfo-Cyanine5.5修饰的脱氧尿苷三磷酸（dUTP）衍生物。其基本结构由以下部分组成：

脱氧尿苷三磷酸（dUTP）：是DNA合成的原料之一，结构包含脱氧核糖、尿嘧啶碱基及三磷酸基团。

sulfo-Cyanine5.5荧光染料：一种水溶性、带负电荷的近红外荧光染料，具有光稳定性和高量子产率，发射波长约为695 nm，适合深红至近红外成像。

连接基团：通常通过共价键将sulfo-Cyanine5.5连接到dUTP分子上的核苷碱基或糖部分，使得染料能够随DNA链掺入。

功能和用途

sulfo-Cyanine5.5 dUTP作为一种标记的核苷酸，主要功能是在DNA合成过程中被DNA聚合酶掺入新合成的DNA链中，实现DNA的荧光标记和检测。它的广泛应用包括：

DNA合成与扩增检测
在PCR、核酸扩增技术（如qPCR）或体外转录反应中掺入sulfo-Cyanine5.5 dUTP，能直接在扩增产物中引入荧光标签，无需后续标记步骤，简化流程并提升效率。

荧光原位杂交（FISH）
通过使用sulfo-Cyanine5.5 dUTP标记的探针，可以高灵敏度地检测染色体上的特定序列，实现细胞核或组织切片中目标DNA的定位和定量。

基因表达分析与单分子检测
结合荧光原位扩增技术，可利用该染料的近红外发射优势，实现低背景、高信噪比的基因表达分析，适合单分子水平研究。

细胞和组织成像
其近红外光谱特性使其适合活细胞及活体成像，穿透力强，背景干扰少，特别适合复杂生物样本的荧光成像。

特点

近红外激发与发射波长
sulfo-Cyanine5.5 dUTP在近红外区发射，减少了细胞自发荧光的干扰，提高信号的特异性和灵敏度。

水溶性好，生物相容性佳
sulfo基团增加染料的亲水性，避免染料聚集，提高标记的均一性和稳定性，适合生物体系使用。

高光稳定性和量子效率
该染料具有较高的光稳定性和亮度，适合长时间荧光成像和高灵敏度检测。

直接掺入DNA，简化操作
通过DNA聚合酶直接掺入，无需后续化学反应或标记步骤，便于快速检测。

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