Cy5.5-phosphoramidite,CY5.5标记亚磷酰胺的反应步骤
Cy5.5-Phosphoramidite是一种基于近红外荧光染料Cy5.5的亚磷酰胺衍生物,主要用于核酸合成中引入荧光标签,便于荧光检测与分子追踪。亚磷酰胺化学作为固相寡核苷酸合成的核心步骤,涉及具有高反应活性的亚磷酰胺基团与核苷酸的羟基反应,形成磷酸酯键。将Cy5.5染料修饰于亚磷酰胺骨架,可实现荧光功能的核酸合成标记。
反应体系与底物
Cy5.5-Phosphoramidite常用于固相合成系统,其反应对象为游离5'-羟基的核苷酸或修饰核酸。合成一般在惰性气氛(如氮气或氩气)中进行,防止亚磷酰胺基团被水分水解。
反应溶剂与条件
反应多在无水有机溶剂中进行,如无水的二氯甲烷(DCM)、乙腈(ACN)或二甲基甲酰胺(DMF)。保持反应体系极度干燥,避免水分导致的亚磷酰胺水解,降低产率。温度通常控制在室温(20–25℃),以保证亚磷酰胺的活性和核苷酸的稳定性。
反应步骤
将Cy5.5-Phosphoramidite与5'-羟基的核苷酸固相支持物接触,在催化剂(如四乙基胺盐或二苯基磷酰氯)辅助下,亚磷酰胺基团活化并与羟基发生亲核加成反应,生成磷酸三酯键。
反应时间一般为1-3分钟,快速且高效,确保链延伸的准确性。
反应完成后,加入氧化剂(如碘溶液)氧化磷酸三酯成更稳定的磷酸酯结构。
反应控制要点
无水环境:反应中任何水分均可导致亚磷酰胺水解,产生副产物,降低合成效率。
催化剂和氧化剂的选择:保证反应选择性和产物稳定性,催化剂用量需精确控制。
反应时间与温度:控制合成周期,避免染料或核酸降解。
纯化处理:合成后采用高效液相色谱(HPLC)纯化,去除未反应物和副产物。
光学与化学稳定性
产品名称:Cy5.5-phosphoramidite,CY5.5标记亚磷酰胺
纯度:95%+
性状:固体或液体
储藏条件:-20°C干燥避光保存
包装规格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
厂家:齐岳生物
关于我们
齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务,如活性酯(NHS酯)、马来酰亚胺(MAL)、叠氮(N₃)、炔基(alkyne)等,便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合,实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外,齐岳生物还提供定制染料标记服务,包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物,满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。
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