产品名称：Cy3 SE(mono SO3)的化学结构与性质

一、化学结构与性质

1.1 核心结构

CY3染料核心：属于花菁类荧光染料，具有共轭双键结构，激发波长约510-550 nm，发射波长约570 nm，发出橙红色荧光。

官能团：

单磺酸基团（mono SO3）：引入一个磺酸基团，显著提高水溶性，减少染料分子聚集，增强生物相容性。

反应活性基团（SE）：通常为琥珀酰亚胺酯（NHS ester），可与氨基（-NH₂）发生共价结合，形成稳定的酰胺键，用于生物分子标记。

分子式与分子量：C₃₉H₄₉N₃O₆S，分子量约687.9 g/mol。

1.2 物理性质

外观：深蓝色或绿色固体/粉末。

溶解性：易溶于水、DMSO、DMF，几乎不溶于非极性溶剂。

稳定性：光稳定性好，但需避光保存；磺酸基团在生理pH下稳定。

二、合成方法

2.1 关键步骤

磺化反应：

在CY3染料中引入一个磺酸基团，通常使用氯磺酸等磺化试剂，通过亲电取代反应实现。

反应活性基团引入：

琥珀酰亚胺酯（NHS ester）活化：将CY3的羧酸基团与NHS反应，生成NHS酯，以便与氨基反应。

纯化：

通过沉淀、过滤、干燥等步骤确保纯度，可能使用高效液相色谱（HPLC）进一步纯化。

2.2 反应条件

pH控制：磺化反应需在酸性条件（如浓硫酸）下进行；NHS酯活化需在碱性条件（pH 8-9）下进行。

温度：室温至80℃反应，避免高温导致染料降解。

催化剂：使用EDC（1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺）作为羧酸活化剂。

温馨提示：仅用于科研，不能用于人体实验！wyh

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