HEX Amidite, Single Isomer，一种用于寡核苷酸合成的功能化荧光核苷酸中间体

HEX Amidite, Single Isomer 是一种用于寡核苷酸合成的功能化荧光核苷酸中间体，广泛应用于分子示踪、荧光定量分析和核酸标记研究。HEX（Hexachloro-fluorescein 或 Hexachloro荧光素衍生物）是一种具有高亮度和光学稳定性的红橙色荧光染料，其单异构体形式（Single Isomer）保证了光学性能的一致性和荧光发射的可重复性。在寡核苷酸合成中，HEX Amidite 通过其末端磷酰胺官能团（2-氰乙基二异丙基膦酰胺）与核苷羟基发生高效共价偶联，将荧光染料引入寡核苷酸链中，实现分子可视化和功能化标记。

HEX Amidite, Single Isomer 的设计理念是将荧光染料功能模块与磷酰胺活性端结合，同时通过柔性链（如 C6 或类似链段）保持染料与核苷的空间独立，减少荧光淬灭和分子间干扰，提高寡核苷酸在生物实验中的信号强度和稳定性。单异构体形式可避免由于异构混合造成的光学性能差异，使实验结果更具可重复性。

二、化学结构特点

HEX Amidite, Single Isomer 的化学结构可分为三个核心模块：荧光染料 HEX 核心、柔性连接臂、以及磷酰胺活性端。

1. HEX 荧光染料核心
   HEX 分子包含苯并异噻唑或荧光素核心骨架，并通过氯取代或芳香环修饰增强其光学稳定性和量子产率。其共轭π体系延伸，使分子在红橙波段具有强吸收与发射能力，发射峰通常在 550–570 nm 附近。荧光染料核心在单异构体状态下呈现统一的立体构型，确保光谱性能一致，并降低荧光淬灭或偏移的风险。

2. 柔性连接臂（Spacer）
   HEX 核心与磷酰胺官能团之间通常通过柔性链（如 C6 链段）相连。此链段提供足够的空间，使染料在寡核苷酸链上保持物理独立，避免与核酸主链发生 π–π 堆积或静电相互作用，从而最大化荧光信号强度。柔性链的长度和结构设计也利于染料与目标分子之间的空间适配，提升寡核苷酸在体内外实验中的可识别性。

3. 磷酰胺活性端
   HEX Amidite 的末端为 2-氰乙基二异丙基膦酰胺官能团，可在固相寡核苷酸合成中与核苷 5'-羟基发生亲核取代反应，形成稳定的磷酰胺键。这种磷酰化反应高效、可控，并在温和条件下完成，保证 HEX 染料和核苷链结构完整。磷酰胺活性端的存在还允许在不同分子或载体系统上进行模块化功能化，例如可用于荧光标记、靶向配体修饰或药物递送系统构建。

4. 结构稳定性与生物兼容性
   HEX Amidite, Single Isomer 结构中，磷酰胺键和柔性链保证了化学稳定性，避免水解或降解；单异构体形式确保光学性质一致。其柔性链和水溶性端基使其在缓冲体系中分散均匀，减少非特异性吸附，增强生物兼容性。在实验中，这种结构特点使 HEX Amidite 能够在固相合成、荧光检测和细胞成像中表现出稳定可靠的性能。

产品名称：HEX Amidite, Single Isomer

纯度：95%+

性状：固体或液体

储藏条件：-20°C干燥避光保存

包装规格：50mg  100mg  250mg  500mg（按需提供）

厂家：齐岳生物

关于我们

齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务，如活性酯（NHS酯）、马来酰亚胺（MAL）、叠氮（N₃）、炔基（alkyne）等，便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合，实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外，齐岳生物还提供定制染料标记服务，包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物，满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。

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