• linker分类

连接子（linker）在蛋白质降解靶向嵌合体（PROTAC）和其他药物设计中具有多种类型，根据其结构和性质的不同，连接子可以分为多种分类。以下是一些常见的连接子分类：

长度分类：

短连接子：一般长度在1-5个原子或分子团之间。

中连接子：长度介于5-10个原子或分子团之间。

长连接子：长度超过10个原子或分子团。

柔性性分类：

刚性连接子：结构较为刚硬，不易变形。

柔性连接子：结构较为柔软，具有一定的自由度。

化学性质分类：

非极性连接子：主要由碳和氢原子组成，例如烷基链。

极性连接子：含有带电荷或具有亲水性的基团，例如氨基酸残基、羟基等。

功能性分类：

氨基酸连接子：包括甘氨酸、赖氨酸等天然氨基酸。

非天然氨基酸连接子：设计和合成的氨基酸类似物，具有特定的功能性质。

杂环连接子：包括噻吩、嘧啶等含有杂原子的环状结构。

功能性团分类：

羟基连接子：包括乙二醇、甘油等含有羟基的分子。

硫醚连接子：包括二硫桥等连接子，具有一定的稳定性和特殊的生物活性。

这些分类方式通常是相互重叠的，连接子的选择取决于具体的应用需求和设计目的。在PROTAC和其他药物设计中，连接子的选择和优化对于药物的活性、特异性和药代动力学性质具有重要影响。

• linker设计

在蛋白质降解靶向嵌合体（PROTAC）中，连接子（linker）是连接靶向蛋白结合部分和泛素连接酶（E3 ligase）结合部分的部分。连接子在PROTAC设计中起着至关重要的作用，因为它可以影响到PROTAC的生物活性、选择性和药代动力学性质。

连接子的设计通常考虑以下几个因素：

长度和柔性： 连接子的长度和柔性会影响到靶向蛋白和E3 ligase结合部分之间的距离和空间构型，从而影响到PROTAC的活性。

稳定性： 连接子需要具有足够的稳定性，以保持PROTAC的整体结构，并在细胞内保持活性。

水溶性： 连接子通常需要具有一定程度的水溶性，以便在细胞内有效地传递。

靶向性： 连接子的设计也可能考虑到增加对靶向蛋白的亲和力，以提高PROTAC的效率。

代谢稳定性： 连接子需要具有一定的代谢稳定性，以保持其在细胞内的活性。

连接子的设计通常需要结合以上因素综合考虑，并根据具体的靶向蛋白和E3 ligase的选择进行优化。优化的连接子设计可以显著影响到PROTAC的活性和选择性，从而影响到其在药物研发中的应用

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