SS-31（序列：D-Arg-2',6'-dimethyltyrosine-Lys-Phe-NH₂）是一种短链抗氧化肽，其分子结构中含有的苯酚类基团可靶向清除线粒体内过量的活性氧（ROS）。通过与AF系列荧光染料（如AF488、AF647）通过硫醚键或酰胺键共价偶联，形成AF染料-SS-31复合物。该设计既保留了SS-31的线粒体靶向能力（通过正电荷与线粒体膜电位相互作用），又赋予其荧光可视化特性，便于在共聚焦显微镜或流式细胞术中追踪肽段在细胞内的分布与动态。实验表明，AF标记未显著影响SS-31的抗氧化活性，且在氧化应激模型中可观察到其优先富集于线粒体基质。此复合物常用于线粒体功能研究及药物递送系统的体内外示踪。
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