Cy5 dimethyl是一种广泛应用于生物医学和分子生物学领域的荧光染料，属于Cyanine染料家族中的重要成员。Cy5是基于Cyanine骨架设计的一类红色荧光染料，激发和发射光谱位于可见光的远红外区，常用于多色荧光成像、分子探针制备、细胞标记和荧光定量分析。Cy5 dimethyl是Cy5染料的一个修饰版本，带有两个甲基取代基，进一步优化了染料的物理化学性质和光学性能。

结构及化学性质

Cy5 dimethyl染料分子基于典型的Cyanine结构，由两个含氮杂环通过五个共轭碳原子桥联形成较长的共轭体系。该共轭体系是其激发发射波长较长的基础。dimethyl部分代表染料分子中存在两个甲基取代基，增加了染料的疏水性和光稳定性。

这种结构使Cy5 dimethyl具有较强的电子离域效应，形成宽广的光谱吸收和发射峰。其化学结构通常带有活性修饰基团（如NHS酯、Maleimide、azide等），便于与生物分子（蛋白质、核酸、糖类等）通过共价键结合，构建功能化的荧光标记物。

Cy5 dimethyl在水中有一定的溶解性，但为了提高稳定性和标记效率，通常以DMSO等有机溶剂制备储备液，使用时稀释至水溶液中。染料对光和氧气敏感，需在避光、低温条件下保存。

生物医学应用

Cy5 dimethyl作为强效荧光探针，在多种生物医学技术中发挥关键作用：

蛋白质和抗体标记
Cy5 dimethyl可通过NHS酯等活性基团与蛋白质中的氨基结合，实现抗体、酶、受体等蛋白的荧光标记，支持免疫荧光染色、Western blot和ELISA等实验。

核酸探针和分子杂交
用于寡核苷酸、DNA和RNA的标记，便于FISH（荧光原位杂交）、微阵列分析和定量PCR中靶分子的检测，帮助基因表达和序列变异研究。

细胞成像与流式细胞术
Cy5 dimethyl标记的抗体或配体可用于细胞表面标记和内吞监测，结合共聚焦显微镜和流式细胞仪，支持多参数细胞分析及活细胞成像。

多色荧光共定位和多重检测
由于其发射波长与其他常用荧光染料（如FITC、Cy3）有明显区分，Cy5 dimethyl适合与多种染料组合，实现多重标记和多通道成像。

生物传感器和纳米材料标记
Cy5 dimethyl常用来标记纳米颗粒、脂质体、蛋白复合物等，参与生物传感器的构建及药物递送系统的追踪。

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