CY3-TFO,CY3标记的三联体形成寡核苷酸化学反应原理
TFO(Triplex-Forming Oligonucleotide,三联体形成寡核苷酸)是一类能够通过三链螺旋结构与特定DNA序列结合的寡核苷酸。Cy3-TFO是在TFO分子上共价连接荧光染料Cy3,实现分子标记和可视化的复合物。其化学反应原理涉及荧光标记的共价偶联及三联体形成的分子互作机制。
首先,Cy3标记通常通过TFO的端基氨基或修饰碱基上的活性氨基官能团与Cy3-NHS酯发生酰胺键形成的共价反应。该反应在弱碱性缓冲液(pH 8.0–8.5)中进行,NHS酯基团与氨基亲核攻击生成稳定的酰胺键,确保Cy3牢固附着于TFO上,同时避免干扰其三联体形成能力。
标记后,Cy3-TFO可通过碱基互补及Hoogsteen或反Hoogsteen氢键与靶DNA序列中的特定三聚体序列形成稳定的三链结构。该三联体结构增强了TFO与靶序列的结合特异性及稳定性,应用于基因调控和分子识别。
荧光标记的Cy3赋予TFO在细胞内外研究中可视化的功能,利用荧光共振能量转移(FRET)、荧光成像等技术动态监测三联体的形成与解离过程,研究其与DNA的相互作用和构象变化。
此外,Cy3的光学特性使得该标记在不同环境下具有高荧光强度和良好的光稳定性,保证实验过程中信号的准确和持续。荧光信号的变化还可以反映三联体的结合动力学,辅助定量分析TFO-DNA相互作用的结合常数和解离速率。
总结,Cy3-TFO的化学反应原理综合了共价标记的酰胺键形成与三联体形成的氢键作用,通过荧光标记实现对特定DNA序列的高选择性识别及动态追踪,为基因表达调控和核酸结构研究提供了有力工具。
产品名称:CY3-TFO
纯度:95%+
性状:固体或液体
储藏条件:-20°C干燥避光保存
包装规格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
厂家:齐岳生物
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齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务,如活性酯(NHS酯)、马来酰亚胺(MAL)、叠氮(N₃)、炔基(alkyne)等,便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合,实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外,齐岳生物还提供定制染料标记服务,包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物,满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。
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