产品名称：Cy3.5 DiAcid的化学结构与性质与合成方法

一、化学结构与性质

1.1 核心结构

CY3.5染料核心：属于花菁类荧光染料，具有共轭双键结构，激发波长（Ex）为555 nm，发射波长（Em）为570 nm，发出橙红色荧光。

官能团：

双羧酸基团（DiAcid）：提供反应活性，可与氨基（-NH₂）通过酰胺键偶联，用于生物分子标记。

分子式与分子量：C₄₃H₄₉ClN₂O₄，分子量约692.34 g/mol。

1.2 物理性质

外观：深蓝色或绿色固体/粉末。

溶解性：易溶于DMF、DMSO等有机溶剂，难溶于水（需通过磺酸基团提高水溶性，但Cy3.5 DiAcid主要含羧酸基团）。

稳定性：光稳定性好，但需避光保存；羧酸基团在生理pH下稳定。

二、合成方法

2.1 关键步骤

花菁骨架合成：通过缩合反应（如吲哚盐与季铵盐反应）构建CY3.5染料核心。

羧酸基团引入：

直接氧化：将CY3.5的甲基酯基团（如-COOCH₃）在碱性条件下水解，生成羧酸基团（-COOH）。

后修饰：将CY3.5与氨基乙酸（glycine）或乙二酸（oxalic acid）反应，通过酰胺键或酯键连接羧酸基团。

纯化：通过高效液相色谱（HPLC，C18柱）或离子交换色谱去除未反应试剂和小分子杂质。

2.2 反应条件

pH控制：羧酸基团引入需在碱性条件（pH 8-9）下进行。

温度：室温至80℃反应，避免高温导致染料降解。

催化剂：使用EDC（1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺）作为羧酸活化剂。

温馨提示：仅用于科研，不能用于人体实验！wyh

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