Tide Quencher 3 Phosphoramidite 是一类用于固相寡核苷酸合成的高效荧光淬灭剂。
它将Tide Quencher 3 系列的核心荧光淬灭结构与磷酰胺基团(phosphoramidite)结合,使其能够直接在DNA或RNA合成过程中通过标准自动化寡核苷酸合成技术(DNA/RNA合成仪)进行共价接入。该分子的设计充分考虑了化学稳定性、反应活性以及水溶性,确保在合成和后续应用中都能保持高效的淬灭功能。
Tide Quencher 3 Phosphoramidite 的核心淬灭结构能够吸收广泛波段的荧光能量,并将其无辐射性释放,从而实现对荧光信号的高效抑制。
在寡核苷酸探针设计中,它通常用于构建 FRET 探针,其中淬灭剂位于寡核苷酸末端,与荧光团相互作用,使荧光信号在未结合或特定构象下被抑制。当目标核酸结合后,空间结构变化导致淬灭效果减弱,荧光信号被释放,从而实现敏感的检测和高信噪比分析。
磷酰胺基团使Tide Quencher 3 Phosphoramidite 能够在寡核苷酸合成的氧化阶段参与化学反应,与合成链末端形成稳定的磷酸二酯键连接。该反应条件温和、可控,对核酸链和其他修饰基团的稳定性影响小。此外,该试剂设计有一定水溶性,便于溶解于有机合成溶剂中,同时保持高反应效率,减少非特异性副反应。
在实验应用方面,Tide Quencher 3 Phosphoramidite 广泛用于DNA探针、分子信标(Molecular Beacon)、siRNA 标记以及核酸基因检测探针的设计。通过精确调控淬灭剂与荧光团之间的距离与相对位置,可获得可逆或条件响应型的荧光信号变化,适合高通量基因检测、实时定量PCR、核酸相互作用研究等多种分子生物学实验。
名称:Tide Quencher3 phosphoramidite
用途:科研
状态:固体/粉末/溶液
保存:冷藏
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