常用名 BHQ-3 酸
英文名 BHQ-3 acid
CAS号 1338332-66-3
分子量 547.68
分子式 C33H35N6O2+
熔点 N/A
BHQ-3 Acid 的全称为 Black Hole Quencher 3 Acid,是一种高效、非发光型荧光淬灭剂,属于 黑色孔淬灭染料(Dark Quencher) 家族。
结构上,BHQ-3 Acid 由 高度共轭的芳香环系统 构成,没有自身可检测的荧光发射,因此能够高效吸收来自特定波长荧光染料的能量,实现荧光淬灭作用。分子末端含有羧基,使其可以通过 酰胺化或酯化反应 与生物分子共价连接,从而构建荧光淬灭体系。
化学活性与功能特点
高效淬灭能力:
BHQ-3 能够通过非辐射能量转移(FRET 或静态淬灭机制)吸收红光荧光染料发射的能量,将其转化为热能,而不产生荧光信号,从而实现高效淬灭。
高效淬灭降低背景信号,提高荧光实验的信噪比。
羧基可衍生化:
分子末端羧基可与蛋白质、寡核苷酸或其他含氨基的生物分子共价结合,构建淬灭探针或 FRET 系统。
可通过 NHS 酯化等化学手段方便地连接至目标分子。
非发光性质:
BHQ-3 本身不发光,避免背景信号干扰,使其在多色荧光实验和 FRET 探针设计中具有明显优势。
波长匹配性:
主要吸收红光波段荧光染料的发射光,如 Cy5、Alexa Fluor 647 等,适用于红光荧光探针和实时 PCR、FRET 实验设计。
应用领域
荧光淬灭探针构建:
BHQ-3 常用于 DNA/RNA 探针、分子信号探针和荧光标记系统中,通过与荧光染料成对构建 FRET 探针,实现高灵敏度分子检测。
实时定量 PCR(qPCR):
在 qPCR 探针(如 TaqMan 探针)中,BHQ-3 作为淬灭剂与红光荧光染料组合,监测荧光信号变化,实现高灵敏的核酸定量。
分子相互作用研究:
利用 BHQ-3 与荧光染料构建 FRET 系统,可研究蛋白质-蛋白质、蛋白质-核酸或小分子相互作用。
生物传感器与活性探针:
通过荧光-淬灭对设计环境敏感探针,可实现酶活性检测、分子识别及信号放大。
多色荧光实验:
由于自身不发光,可与其他荧光染料组合,实现多色荧光检测而不产生背景干扰。
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