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HCQ-2 Phosphoramidite,荧光淬灭剂HCQ-2 亚磷酰胺的化学结构特点
发布时间:2025-09-10     作者:axc   分享到:

HCQ-2 Phosphoramidite,荧光淬灭剂HCQ-2 亚磷酰胺的化学结构特点

HCQ-2 Phosphoramidite(HCQ-2 phosphoramidite)是一种用于寡核苷酸化学合成的高效荧光淬灭剂(fluorescence quencher)单体。作为荧光探针设计的重要组成部分,HCQ-2 phosphoramidite能够通过磷酰胺化学修饰整合入寡核苷酸链中,在核酸杂交、实时荧光检测(qPCR)、FRET探针以及分子开关等应用中发挥重要作用。与其前身HCQ-1相比,HCQ-2在淬灭效率、光稳定性及分子设计上进行了优化,能够更高效地调控荧光信号,实现灵敏、的分子检测。

HCQ-2 phosphoramidite的化学结构特点主要包括三个核心部分:荧光淬灭核心、核苷酸衍生单元以及磷酰胺活化基团。荧光淬灭核心通常为杂环芳香体系,具有宽吸收带和高电子接受能力,能够通过非辐射能量转移或电子猝灭有效抑制邻近荧光染料的发光。核苷酸衍生单元常与脱氧核糖或核苷类似结构连接,使其能够像常规核苷酸一样被固相DNA合成仪整合进寡核苷酸链。磷酰胺活化基团保证其在固相合成条件下化学稳定,同时在去保护和去除合成支撑后保留淬灭功能。

HCQ-2 phosphoramidite的化学结构优化体现为增强的电子离域和空间排列,使其在荧光猝灭中表现出更高的效率。其淬灭机制依赖于FRET(荧光共振能量转移)或PET(光电子转移)效应。当HCQ-2与荧光染料(如FAM、Cy3、Cy5等)在寡核苷酸链中靠近时,能量通过非辐射途径转移到HCQ-2分子,实现荧光信号的抑制。这种空间依赖性和序列整合特性使HCQ-2能够作为可靠的“关断”模块,在荧光探针、分子开关和FRET系统中提供高信噪比和动态响应。

在结构设计上,HCQ-2 phosphoramidite强调化学稳定性和反应兼容性。其荧光淬灭核心具有抗光漂白特性,能够在酸碱条件、有机溶剂及高温固相合成过程中保持完整。磷酰胺基团的保护设计保证了其在固相合成中不被水解,去保护后仍能保持活性淬灭能力。与核酸链结合后,HCQ-2对寡核苷酸的二级结构影响小,不影响正常杂交或DNA/RNA二级结构的形成,从而保证其在分子探针和荧光检测中的功能稳定性。

HCQ-2 phosphoramidite的化学结构特点还包括其位置灵活性和可调淬灭效果。研究者可以根据荧光探针设计需求将HCQ-2置于寡核苷酸的端位、链内或间隔位置,通过调节与荧光染料的距离实现不同程度的荧光抑制。这种灵活性在实时荧光检测、分子逻辑门或多通道FRET探针中尤为重要,可提高实验的灵敏度和性。

综上所述,HCQ-2 phosphoramidite是一种高效、稳定且可整合入寡核苷酸的荧光淬灭剂单体,其化学结构特点包括:杂环芳香淬灭核心、核苷酸衍生单元及磷酰胺活化基团,保证了高淬灭效率、固相合成兼容性和荧光调控灵活性。通过空间依赖的FRET或PET机制,HCQ-2可有效抑制荧光信号,实现核酸探针、FRET系统及分子开关的精准调控,是现代分子生物学、荧光检测及核酸化学研究中不可或缺的重要工具。

产品名称:HCQ-2 Phosphoramidite

纯度:95%+

性状:固体或液体

储藏条件:-20°C干燥避光保存

包装规格:50mg  100mg  250mg  500mg(按需提供)

厂家:齐岳生物

HCQ-2 Phosphoramidite

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