CY3-5-氟脱氧尿嘧啶-5′-单磷酸酯（Cy3-5-FdUMP）化学结构特点

CY3-5-氟脱氧尿嘧啶-5′-单磷酸酯（Cy3-5-FdUMP）是一种通过化学修饰将荧光染料 CY3 与 5-氟脱氧尿嘧啶-5′-单磷酸酯（5-FdUMP）偶联形成的标记核苷酸衍生物。5-FdUMP 是一种脱氧核苷酸类似物，其分子结构由氟化脱氧尿嘧啶碱基、脱氧核糖和磷酸基团组成。碱基上的氟原子取代了 5 号位氢，增强了化学特性与反应位点的稳定性，而 5′-磷酸基团则赋予分子亲水性并提供负电荷，使其在水相环境中具有良好溶解性。CY3 为三苯基甲基荧光染料，激发波长约为 550 nm，发射波长约为 570 nm，其结构中包含共轭 π-电子体系，使其具有稳定的荧光特性。

Cy3-5-FdUMP 的化学结构特点首先体现在碱基与荧光团的共价连接上。CY3 通常通过活化衍生物（如 CY3-NHS 酯）与 5-FdUMP 分子的磷酸或羟基官能团偶联，形成稳定的酯或酰胺键。该偶联方式保证了核苷酸主链及磷酸骨架的完整性，同时将荧光团固定在分子上，实现标记与分子功能的兼顾。通过选择适当的偶联位点，CY3-5-FdUMP 保持了核苷酸的结构特征，同时赋予可检测的荧光信号，便于分子行为研究。

其次，该分子的负电荷分布和亲水性使其在水相体系中稳定。5′-磷酸基团携带负电荷，可与阳离子分子或载体形成静电相互作用，为后续分子嵌入或复合提供便利。脱氧核糖骨架提供一定的柔性，使荧光团和核苷酸之间形成空间隔离，降低荧光淬灭或分子聚集对信号的影响。同时，氟取代的碱基位置增加了分子在化学体系中的稳定性，降低了非特异性反应的可能性。

Cy3-5-FdUMP 的共轭体系和立体结构也值得关注。CY3 荧光团的苯环和共轭双键体系延伸了 π-电子分布，使荧光信号强度高且稳定。核苷酸部分则通过糖-磷酸骨架与碱基保持刚性排列，这种刚性结构为分子在水溶液或载体体系中的分布提供了可预测性，同时减少了偶联后荧光团旋转或能量弛豫导致的信号损失。整体分子呈现出一定的二维分布特性，碱基与荧光团之间的空间隔离有利于在分子追踪和生化分析中保持荧光性能。

此外，Cy3-5-FdUMP 的化学结构允许其在不同环境下保持功能稳定性。磷酸基团和碱基结构使其能够参与分子识别、嵌入载体或与蛋白质相互作用，同时 CY3 的荧光性质提供了实时监测能力。该结构特性使其在分子行为研究、药物递送系统分析和核苷酸模拟研究中具有广泛适用性。

总体而言，CY3-5-氟脱氧尿嘧啶-5′-单磷酸酯具有碱基氟取代增强稳定性、磷酸骨架提供负电荷和水溶性、脱氧核糖提供柔性与空间隔离、以及 CY3 荧光团赋予可视化信号的综合化学结构特点。通过合理设计偶联策略，分子在保持核苷酸骨架完整性的同时，实现了可追踪、可分析的荧光标记，为核苷酸行为研究、分子分布分析及药物递送研究提供了可靠的化学基础。

产品名称：CY3-5-氟脱氧尿嘧啶-5′-单磷酸酯（Cy3-5-FdUMP）

纯度：95%+

性状：固体或液体

储藏条件：-20°C干燥避光保存

包装规格：50mg  100mg  250mg  500mg（按需提供）

厂家：齐岳生物

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齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务，如活性酯（NHS酯）、马来酰亚胺（MAL）、叠氮（N₃）、炔基（alkyne）等，便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合，实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外，齐岳生物还提供定制染料标记服务，包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物，满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。

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