中文名称:四甲基罗丹明亚磷酰胺
英文名称:TAMRA Amidite, 5-isomer
用途:科研
状态:固体/粉末/溶液
保存:冷藏
供应:西安齐岳生物科技有限公司

TAMRA Amidite(5-isomer)是一类广泛用于寡核苷酸标记、探针构建与高灵敏度分子分析的荧光亚磷酰胺单体,其核心结构为四甲基罗丹明(Tetramethylrhodamine, TAMRA),并通过磷酰胺化修饰使其能够在 DNA/RNA 固相合成中作为 5′ 端或内部修饰引入。TAMRA 作为经典的罗丹明类染料之一,具有优异的光稳定性、较高的荧光量子产率以及显著的抗光漂白性能,因此在 FRET 探针、实时 PCR 探针、寡核苷酸生物成像与诊断分析中得到广泛应用。TAMRA Amidite 的 5-isomer(位点异构体)在合成中表现出更高的稳定性与更佳的标记一致性,使其成为商业化寡核苷酸修饰的主流产品之一。
在分光特性方面,TAMRA 的典型吸收峰位于约 555 nm,发射峰位于 580–585 nm,呈现明亮的橙红色荧光。其荧光特性对 pH 的敏感性较低,在中性与弱酸条件中保持稳定,适用于生物体系。相较于其他罗丹明类染料,TAMRA 在水溶性、抗光漂白能力与化学耐受性方面表现良好,因此能够在严苛的寡核苷酸脱保护和纯化过程中保持稳定。使用 TAMRA Amidite 进行固相合成时,其 DMT 和磷酰胺保护基可与常规 DNA 合成化学完全兼容,适用于高通量自动化合成仪。通常建议将耦合时间延长至 10–15 分钟,以保证足够的耦合效率。
TAMRA Amidite(5-isomer)被用于多种荧光探针平台,包括 TaqMan 探针、Molecular Beacon、FRET 双标探针、aptamer 荧光传感系统等。在 FRET 应用中,TAMRA 常作为受体染料与荧光素(FAM)、Alexa Fluor 488 等供体构建能量转移对,用于精准监测核酸杂交、酶切反应、蛋白-核酸相互作用等生物事件。在实时 PCR 中,TAMRA 标记的探针具有高信噪比和低背景优势,有助于提高检测灵敏度与定量精度。
在化学稳定性方面,TAMRA 的罗丹明结构环系具有高刚性,能够显著减少非辐射跃迁,从而提高荧光效率。同时,四甲基结构增强了染料的疏水性,使其在寡核苷酸修饰后的分离纯化中表现出良好的色谱可控性。
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