常用名 5'-Amino-Modifier C6-TFA 亚磷酰胺单体
英文名 N-trifluoroacetyl (TFA)CAS号 133975-85-6
分子量 413.41500
沸点 433.696ºC at 760 mmHg
分子式 C17H31F3N3O3P
闪点 216.092ºC

5'-Aminooxy-Modifier-6-CE Amidite 是一种用于寡核苷酸合成的功能性修饰单体,设计用于在寡核苷酸的 5' 末端引入氨基氧基(–ONH₂)官能团。该修饰可与羰基化合物(如醛、酮)通过稳定的氨基氧基-羰基化学键(oxime linkage)形成共价偶联,实现寡核苷酸与多种生物活性分子、荧光染料、亲和标签或聚合物的高效功能化。
结构与化学特性
5'-Aminooxy-Modifier-6-CE Amidite 由三部分组成:
磷酰胺(CE, β-cyanoethyl)活性基团
该基团适用于自动化固相寡核苷酸合成,可在标准的 DNA/RNA 合成周期中高效整合氨基氧基修饰。CE 基团在碱性脱保护步骤中可去除,不影响最终寡核苷酸结构。
6-碳间隔臂(Hexyl spacer)
提供柔性链,使修饰末端的氨基氧基能够有效接近反应分子,提高偶联效率,同时减少对寡核苷酸二级结构的干扰。
氨基氧基修饰(Aminooxy, –ONH₂)
氨基氧基是一种高选择性官能团,可与醛或酮基团形成稳定的羰基-氨基氧基加成物(oxime),该反应在温和条件下快速进行,无需催化剂,适合水相反应,保持寡核苷酸及偶联分子功能活性。
应用范围
寡核苷酸功能化
可在 5' 末端引入荧光染料(FAM、Cy3、Cy5)、生物素(Biotin)、小分子配体或其他功能基团,实现定制化探针设计。
分子探针与 FRET 探针构建
通过氨基氧基与羰基配体偶联,可制备分子信号探针、荧光共振能量转移(FRET)探针,用于核酸检测、基因表达分析及高通量筛选。
生物标记与靶向修饰
与生物素、荧光染料、药物分子或聚合物共价连接,实现寡核苷酸载体的靶向化或多功能化。
多色荧光及原位杂交(FISH/ISH)
适合与不同荧光基团组合,实现多色共成像及高分辨率原位检测。
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