常用名 dI 亚磷酰胺单体
英文名 DMT-dI Phosphoramidite
CAS号 141684-35-7
分子量 754.811
沸点 857.1±65.0 °C at 760 mmHg
分子式 C40H47N6O7P
闪点 472.2±34.3 °C

5′-DMT-deoxyInosine(简称 5′-DMT-dI)是一种用于寡核苷酸化学合成的非标准核苷单体,其核心结构为脱氧肌苷(deoxyinosine),并在 5′ 羟基位置引入二甲氧基三苯甲基(DMT)保护基,以适配固相磷酰胺合成工艺。该产品可作为修饰核苷单体在 DNA 合成过程中被引入,用于构建具有特殊碱基配对和识别特性的寡核苷酸。
脱氧肌苷是一种含次黄嘌呤(Hypoxanthine)碱基的核苷,其碱基结构介于腺嘌呤和鸟嘌呤之间,具有较为宽松的碱基配对能力。在 DNA 双链中,肌苷可以与 A、C 或 T 等多种碱基形成相对稳定的配对,因此常被称为“通用碱基”之一。这一特性使 deoxyinosine 在引物设计、突变研究和序列多样性分析中具有重要应用价值。
5′-DMT 保护基的引入使 deoxyinosine 能够与标准脱氧核苷单体一样,顺利参与自动 DNA 合成仪上的固相合成流程。DMT 基团不仅提供了化学稳定性,还允许通过常规脱保护监测合成效率,确保修饰位点的准确引入。该产品在合成条件、偶联效率和稳定性方面均与标准核苷单体具有良好兼容性。
在合成和后处理过程中,5′-DMT-deoxyInosine 可耐受标准的氧化、封端及碱性脱保护步骤,不易发生降解或侧反应。合成完成后的寡核苷酸可通过常规反相 HPLC 或 PAGE 方法进行纯化,获得高纯度、结构明确的产物。
在应用方面,含肌苷的寡核苷酸常用于设计兼容多个序列变异的引物或探针,尤其适合 SNP 分析、病毒或病原体多变区域检测以及退化引物设计。此外,在研究 DNA 聚合酶对非标准碱基识别与延伸机制、核酸稳定性及结构功能关系等基础研究中,5′-DMT-dI 也是一种重要工具。
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