CY5 COOH，羧基化CY5，Carboxylated Cyanine5的合成及纯化过程

英文名称（English Name）：CY5-COOH (Carboxylated Cyanine5 Dye)

中文名称（Chinese Name）：羧基化CY5（CY5-COOH）

结构与特点（Structure & Features）：
CY5-COOH 是一种带羧基官能团的荧光染料，属于 Cyanine 类染料，具有较长的共轭 π-体系和红光荧光特性。其分子核心由两个含氮杂环通过亚甲基桥（–CH=CH–）连接形成共轭链，延伸的共轭结构赋予其吸收和发射波长分别在约 650 nm 和 670 nm 的红光区域。末端羧基（–COOH）提供化学偶联位点，可通过酰化或羧基活化与蛋白质、多肽、纳米载体或聚合物共价结合，实现功能化材料或生物标记应用。CY5-COOH 分子量适中，水溶性良好，在有机溶剂（如DMSO、DMF、乙醇）中也可溶解，便于实验操作。

合成过程（Synthesis Process）：

1. Cyanine 核心构建（Cyanine Core Formation）

• CY5 核心由两分子含氮杂环（如吡啶或吲哚衍生物）通过亚甲基桥或醛-胺缩合反应形成长共轭链。

• 反应通常在干燥有机溶剂（如乙醇、甲苯）中进行，加入适量碱性催化剂（如碳酸钾），回流反应数小时至完成。

• 形成的共轭染料呈深蓝或紫红色，具强光吸收特性。

2. 羧基化修饰（Carboxyl Functionalization）

• 在 CY5 核心的一端引入羧基官能团，通常使用含羧基的醛或酸衍生物进行反应，形成末端羧基化结构。

• 反应条件温和，可在室温或略高温下完成，避免染料降解或共轭系统破坏。

3. 保护基处理（Optional Protection/Deprotection）

• 若羧基在反应过程中需要保护，可使用酯类保护基，偶联完成后通过酸或碱处理去除保护基，恢复自由羧基。

纯化过程（Purification Process）：

1. 柱层析（Column Chromatography）

• 通常采用硅胶或C18反相柱进行分离，利用极性差异去除未反应的杂质或副产物。

• 梯度洗脱（如乙腈/水体系或甲醇/氯仿体系）可得到纯净 CY5-COOH。

2. 重结晶（Recrystallization）

• 染料可溶于极性有机溶剂后，通过降温或溶剂挥发结晶，提高纯度和结晶度。

3. 高效液相色谱（HPLC, Optional）

• HPLC 可用于分析纯度，确认 CY5-COOH 分离完成，同时确保染料稳定和杂质去除彻底。

表征方法（Characterization）

• UV-Vis 光谱：确认吸收峰在约 650 nm，评估共轭系统完整性。

• 荧光光谱：检测发射峰约 670 nm，验证荧光特性。

• 质谱（MS）：确认分子量与结构完整性。

总结（Summary）：
CY5-COOH 是一种末端带羧基的红光荧光染料，其合成包括 Cyanine 核心构建、羧基化修饰及保护基处理。纯化主要通过柱层析、重结晶和可选HPLC完成，确保高纯度和稳定性。该染料可通过羧基与蛋白质、多肽或载体偶联，用于生物标记、荧光成像和功能化材料研究，兼具光学活性和化学偶联能力，为生物化学及材料化学实验提供可靠工具。

纯度：95%+

性状：固体或液体

储藏条件：-20°C干燥避光保存

包装规格：50mg  100mg  250mg  500mg（按需提供）

厂家：齐岳生物

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齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务，如活性酯（NHS酯）、马来酰亚胺（MAL）、叠氮（N₃）、炔基（alkyne）等，便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合，实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外，齐岳生物还提供定制染料标记服务，包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物，满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。

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